У Росії малахіт відомий на родовищах Уралу, на території СНД зустрічаємо також на Алтаї та в Казахстані (Жезказган). У вигляді великих мас зустрічається рідко. У Росії родовища практично вичерпані.
У природі малахіт утворюється в зоні окислення – в корі вивітрювання мідних руд, що залягають у вапняках або доломітових і вапняних сланцях. Хімічно сильні підземні води просочують мідний колчедан, руйнують його і забирають у нього мідь, з’єднуючи її з вугільною кислотою сусідніх вапняків.
Головний ворог малахіту – кислота. Причому будь-яка. Боїться цей камінь навіть лимонного соку. Тому вироби з цього мінералу потрібно ретельно берегти від випадкового зіткнення з будь-якою кислотою.